Дата публикации: 15 сентября 2022 г.

EPFL: интеллектуальный микроскоп, обнаруживающий редкие биологические явления

Биофизики Федеральной политехнической школы Лозанны (The École polytechnique fédérale de Lausanne, EPFL) разработали управляющее программное обеспечение, которое оптимизирует сбор данных с помощью флуоресцентных микроскопов на живых образцах.

Изображение: источника.

Их контур управления, используемый для детального отображения митохондриальных и бактериальных участков деления, выпущен в виде плагина с открытым исходным кодом и может вдохновить новое поколение интеллектуальных микроскопов.

Биофизики EPFL нашли способ автоматизировать управление микроскопом для детальной визуализации биологических событий, ограничивая нагрузку на образец, и все это с помощью искусственных нейронных сетей. Их метод работает для деления бактериальных клеток и для митохондриального деления.

Детали их интеллектуального микроскопа описаны в Nature Methods.

«Умный микроскоп похож на беспилотный автомобиль. Ему необходимо обрабатывать определенные типы информации, тонкие паттерны, на которые он затем реагирует, изменяя свое поведение», — объясняет главный исследователь Сулиана Мэнли (Suliana Manley) из Лаборатории экспериментальной биофизики EPFL (EPFL’s Laboratory of Experimental Biophysics). «Используя нейронную сеть, мы можем обнаруживать гораздо более тонкие события и использовать их для изменения скорости сбора данных». 

Мэнли и ее коллеги впервые решили, как обнаружить митохондриальное деление, что сложнее, чем для таких бактерий, как C. crescentus. Митохондриальное деление непредсказуемо, поскольку оно происходит нечасто и может произойти почти в любом месте митохондриальной сети в любой момент. Но ученые решили проблему, обучив нейронную сеть выявлять митохондриальные сужения, изменение формы митохондрий, приводящее к делению, в сочетании с наблюдениями за белками, о которых известно, что они обогащены в местах деления.

«Потенциал интеллектуальной микроскопии включает измерение того, что упускают из виду стандартные измерения», — объясняет Мэнли. «Мы фиксируем больше событий, измеряем меньшие ограничения и можем более подробно отслеживать каждое подразделение».

Источник: actu.epfl.ch

Гасанбекова Л. А. Оценка эффективности финансово-хозяйственной деятельности государственных унитарных предприятий Практическое пособие / Л. А. Гасанбекова, В. И. Никитина, Б. В. Сошников; под общ. науч. ред. канд. экон. наук О. А. Коробко. – М.: ФГБНУ «Аналитический центр» Минобрнауки России, 2019. – 49 с. (ISBN 978-5-904670-54-2). Доступна электронная версия печатного издания.

Вопросы контроля хозяйственной деятельности и финансового аудита, национальной безопасности, системного анализа и управления Сборник материалов III Всеросс. науч.-практ. конф., г. Москва, 29 декабря 2017. – М.: ФГБНУ «Аналитический центр» Минобрнауки России, 2018. – 200 с. (ISBN 978-5-904670-53-5). Доступна электронная версия печатного издания.

открыть полный список изданий Центра →