Дата публикации: 26 ноября 2021 г. ИТМО: ученые определили связь между генами и болезнямиУченые разработали алгоритм, который более точно определит гены, вызывающую ту или иную болезнь Изображение: источника. Исследователи Центра геномного разнообразия ИТМО и НЦМУ «Персонализированной медицины» создали алгоритм под названием GPrior (от английского Gene Prioritizer), который использует массив данных, полученных в результате полногеномного исследования ассоциаций (GWAS), и находит конкретные гены, которые отвечают за ту или иную болезнь. В качестве примера ученые рассматривали шизофрению, коронарную болезнь сердца и воспалительные заболевания кишечника. С помощью GWAS можно получить результат, ограниченный возможностями технологии микрочипового генотипирования ― он позволяет лишь уточнить участки генома (локусы), которые ассоциированы с заболеванием. Но эти участки могут включать десятки генов, из которых только один или несколько действительно связаны с болезнью, поэтому использовать такой метод в разработке тех или иных медицинских решений довольно трудно. Манхэттенский график, изображающий некоторые тесно связанные локусы риска. Каждая точка представляет собой однонуклеотидный полиморфизм, расположение которого в геноме показано на оси Х, а на оси Y показан уровень ассоциации. Пример взят из исследований полногеномных ассоциаций для нарушений микроциркуляции в сосудах. Источник: M. Kamran Ikram / wikipedia.org (CC BY 2.5) «В большинстве случаев сложно с уверенностью говорить о том, что один какой-то ген в большом множестве не отвечает за развитие фенотипа. Когда мы работаем с данными GWAS, мы имеем дело с ограниченным числом положительных примеров (генов, роль которых в развитии фенотипа мы точно знаем) и большим количеством генов, про которые ничего нельзя сказать конкретно (то есть они скрыто-положительные или скрыто-отрицательные). Задача нашего алгоритма состоит в разгадывании этого ребуса ― мы стремимся разметить все эти неизвестные данные», ― рассказывает Никита Колосов, автор исследования, сотрудник Международной лаборатории «Компьютерные технологии», программист Центра геномного разнообразия и НЦМУ «Персонализированной медицины». Схема работы алгоритма GPrior. Источник: изображение из статьи. Статья об исследовании опубликована в журнале European Journal of Human Genetics. Источник: news.itmo.ru
Популярные издания ФГБНУ «Аналитический центр»
Издания 2019 года
Издания 2018 года
открыть полный список изданий Центра → Документ был изменён 11.11.2019 в 10:50. |
Поиск данных
об аттестации педагогических работников Издания Центра
|